Το Ίδρυμα Κόκκαλη συνεχίζει από το 2006, να ενισχύει οικονομικά το Ελληνικό Κέντρο Νευροχειρουργικής Έρευνας, Καθηγητής Πέτρος Σ. Κόκκαλης (ΕΚΝΕ), στο Νοσοκομείο Ευαγγελισμός.
Το Κέντρο ξεκίνησε να λειτουργεί την άνοιξη του 2004 και προσφέρει τις εγκαταστάσεις και τις υπηρεσίες του σε επαγγελματίες και ερευνητές από το χώρο της υγείας. Στη διάρκεια της λειτουργίας του, το ΕΚΝΕ έχει επιδείξει σημαντικό κλινικό, ερευνητικό και εκπαιδευτικό έργο, με διεθνή απήχηση, όπως την Ίδρυση «Προγράμματος Μεταπτυχιακών Σπουδών Κλινική και Πειραματική Νευροχειρουργική», τη Διοργάνωση Διεθνών Σεμιναρίων στο «Πειραματικό Εργαστήριο Νευροχειρουργικής Ανατομίας», τη Λειτουργία Εργαστηρίων: Νευροψυχολογίας, Νευροβιολογίας, Ακτινοχειρουργικής / Ακτινοθεραπείας, Επεμβατικής Ακτινολογίας και άλλα.
